香港特區政府除了由政府部門執行政策外，還有不少公營機構，負責政府認為較需要社會人士參與的工作。這些機構由特區政府出資成立及資助，但不屬於政府體制，較政府部門有較多的自主權，如管理全香港所有公立醫院的醫院管理局、協助香港工業發展的香港生產力促進局等。
財經事務及庫務局局長於「香港金融產業助力內地企業揚帆出海」交流午餐會會見傳媒答問內容（只有中文）（附圖）
財經事務及庫務局局長在「香港金融產業助力內地企業揚帆出海」交流午餐會致辭全文（只有中文）（附圖）
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自回归以来，「一国两制」成功实践是香港长期繁荣稳定的最佳制度保障。香港几年来经历了风风雨雨，现正「由乱到治」迈向「由治及兴」的关键时刻。
第三層是部門，是政府政策的執行部門，由首長級公務員領導，例如衞生署、警務處、社會福利署、建築署等。
行政長官是香港政府的政府首腦，負責領導香港特別行政區政府，此職位成立於一九九七年，大致代替香港總督的職權。轄下由三層架構組成：
的政治體制是行政長官負責制,即行政主導、司法獨立、行政與立法既相制約又相配合。
政府介紹,歷史沿革,特區政府機構,行政會議,公營機構,機構名稱改編,行政機構,行政職稱,立法機構,司法機構,職能機構,
將派出軍隊,進駐香港,執行防務任務。為了保障香港駐軍依法履行職責,維護國家的主權...
香港特別行政區公務員事務局薪級表 （页面存档备份，存于互联网档案馆）
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特區政府已設立不同渠道方便市民提出意見，市民可從專題網站或多個指定地點索閱諮詢文件，出席諮詢活動，或用電郵或郵寄提交意見。市民的聲音直接影響特區政府政策方向，這是香港市民參與社會事務的最佳體驗。市民踴躍反映意見，將有助特區政府更準確掌握民情，制定更貼地的政策。香港的未來，需要特區政府的努力，更需要市民的建言。
香港交接儀式上，港府向中外記者派發的新聞資料時，介紹香港的政治制度是按照「三權分立」的原則建立，有一個「行政主導」的政府，以及「『三權分立』是指行政、立法和司法機關各自獨立運作」。多名立法會議員、特區政府主要官員及法官亦曾明言「香港有三權分立」。
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香港特別行政區政府組織圖（繁體 （页面存档备份，存于互联网档案馆）、簡體 （页面存档备份，存于互联网档案馆））